Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms