Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Hps4Q99KG7 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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