Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Apobec3Q99J72 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms