Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Hoxa13Q62424 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Hoxa13Q62424 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Hoxa13Q62424 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Hoxa13Q62424 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Hoxa13Q62424 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Hoxa13Q62424 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Hoxa13Q62424 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Hoxa13Q62424 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.6 ms