Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rbbp4Q60972 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Rbbp4Q60972 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Rbbp4Q60972 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Rbbp4Q60972 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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Rbbp4Q60972 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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Rbbp4Q60972 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rbbp4Q60972 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms