Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp48Q3V0C5 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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