Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gtpbp6Q3U6U5 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms