Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ttc39dQ0VF76 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ttc39dQ0VF76 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ttc39dQ0VF76 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ttc39dQ0VF76 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Ttc39dQ0VF76 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Ttc39dQ0VF76 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Ttc39dQ0VF76 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ttc39dQ0VF76 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms