Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprkP35822 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprkP35822 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PtprkP35822 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms