Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms