Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Defa-rs1P17533 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Defa-rs1P17533 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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