Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms