Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms