Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms