Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ube3bQ9ES34 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms