Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Rnft1Q9DCN7 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms