Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Ddb2Q99J79 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Ddb2Q99J79 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Ddb2Q99J79 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Ddb2Q99J79 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ddb2Q99J79 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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