Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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