Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf144aQ925F3 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms