Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxa13Q62424 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms