Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms