Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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