Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SbdsP70122 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SbdsP70122 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms