Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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SrprbP47758 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SrprbP47758 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SrprbP47758 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SrprbP47758 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SrprbP47758 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SrprbP47758 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SrprbP47758 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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SrprbP47758 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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SrprbP47758 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SrprbP47758 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms