Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxraP28700 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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