Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms