Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms