Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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