Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms