Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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