Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms