Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Sh3bp5lQ99LH9 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Sh3bp5lQ99LH9 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms