Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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