Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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