Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms