Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Gm28047Q3US59 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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