Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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