Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Rpusd3Q14AI6 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rpusd3Q14AI6 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms