Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pkp1P97350 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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