Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rps29P62274 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms