Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RxraP28700 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms