Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp35M0QWN7 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms