Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
H2-M1F7CXU4 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms