Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms