Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Prrt4B2RU40 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms