Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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