Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cxxc1Q9CWW7 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms