Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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