Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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PtprtQ99M80 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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PtprtQ99M80 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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PtprtQ99M80 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprtQ99M80 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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PtprtQ99M80 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PtprtQ99M80 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprtQ99M80 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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