Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Actn1Q7TPR4 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms